Eğitim alanında da Türkiye ve Filipinler arasındaki ilişkiler güçleniyor. Son dönemde YÖK ile Filipin üniversiteleri arasında imzalanan anlaşmalar kapsamında, öğrenci değişim programlarının artırılması kararlaştırıldı. Özellikle mühendislik, denizcilik ve tarım teknolojileri bölümlerinde ortak araştırmalar yapılacak.

Türkiye’den Filipinler’e giden öğrenciler, İngilizce eğitim fırsatlarından faydalanırken Filipin öğrenciler de Türkiye’de burs imkanlarına erişebiliyor. Erasmus+ ve Mevlana gibi değişim programları sayesinde iki ülke arasındaki öğrenci sayısı hızla artıyor. Uzmanlara göre, bu iş birlikleri iki ülke gençleri arasında kültürel bağları da güçlendirecek.